传染病与预防医学杂志
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用于检测墨西哥克雷塔罗人畜共患结核病的全基因组测序

克劳迪娅·安杰利卡·佩雷亚·拉佐、费里西亚诺·米利安·苏亚索、伊莎贝尔·巴塞纳斯·雷耶斯、苏珊娜·索萨·加列戈斯、艾尔巴·罗德里格斯·埃尔南德斯、苏珊娜·弗洛雷斯·维拉尔瓦和杰米纳尔·豪尔赫·坎托·阿拉尔孔

该研究共收集了墨西哥克雷塔罗州 1,154 名结核病可疑患者的 2,736 份样本、痰液、尿液和其他液体。所有样品均在选择性培养基 Stonebrink 和 Lowenstein-Jensen 中进行抗酸染色和培养。通过 spoligotyping 和单核苷酸多态性 (SNP) 全基因组测序对分离株进行基因分型。将获得的牛分枝杆菌spoligotypes 和 SNP 类型与数据库中发现的牛进行比较。培养获得分枝杆菌21株（1.8%） ，全部来自痰液；两个 (13%) 被鉴定为牛分枝杆菌通过spoligotyping，SB0673和SB0971，这两种病毒在墨西哥的牛身上经常发现。从所有分离株中，对 15 个进行了全基因组测序，确认其中两个为牛分枝杆菌。从人类中分离出来的两种牛分枝杆菌的 SNP 模式与在墨西哥不同地区的牛中发现的相似。