生物化学与药理学：开放获取
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抽象的

抗凋亡蛋白 Calbindin-D28K 环肽抑制剂的计算设计

本杰明·G·博贝、洛根·R·巴特勒和约翰·卡瓦纳

Calbindin-D28K 是一种钙传感器蛋白，负责维持细胞钙稳态，并已知具有抗凋亡特性。本研究的目的是基于已知的蛋白质：蛋白质相互作用，特别是 calbindin-D28K 与 caspase-3 的相互作用，提出 calbindin-D28K 肽抑制剂。通过计算筛选了总共 160,000 种针对 calbindin-D28K 的潜在环肽抑制剂。使用多种评分机制来验证每种环肽抑制剂：钙结合蛋白-D28K 相互作用。环肽的一般共有序列显示出含有至少一种含芳香族氨基酸的正静电特征。随后显示，与得分最高的环肽之一的结合会改变 calbindin-D28K 上的 caspase-3 结合位点。全面的，