蛋白质组学与生物信息学杂志
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人IL-1Ra和大鼠IL-1Ra在大鼠受体上的跨物种氨基酸序列比较和计算对接

Muhammad Sajid Hamid Akash、Kanwal Rehman、Zeeshan Gillani、孙红英和陈淑清

如今，实验动物被广泛用于研究 IL-1Ra 的治疗潜力。本文阐述了 IL-1Ra 氨基酸序列的跨物种比较以及配体（IL-1Ra_ human 和 IL-1Ra_rat）与大鼠受体（IL-1RI_rat）的计算对接。研究的目的是了解氨基酸序列之间的关系、两种配体之间的结构和结合相似性。我们利用分子模型来确定相关蛋白质的结构、序列比对、结构精修和蛋白质对接。我们使用Emboss Needle方法比较验证了两种配体的氨基酸序列，以表达成对序列。此外，这些序列还用于通过 Phyre2 生成配体的 3D 结构模型，并通过 Ramachandran 图进行验证。使用 AutoDock 程序尝试将配体与 IL-1RI_rat 结构对接。IL-1Ra_human和IL-1Ra_rat的序列和结构的相似性和同一性分别为85.4%和73.6%。三个受体残基中的两个，即 LYS290 和 ASP259，在两种配体的对接中很常见。这说明两种配体的结合位点明显相似，表明两种配体可能具有相同的治疗功效。同样，两个物种之间发现的显着相似性的功能意义在未来的研究中可能非常重要，涉及外源性 IL-1Ra 的使用。LYS290 和 ASP259 在两种配体的对接中很常见。这说明两种配体的结合位点明显相似，表明两种配体可能具有相同的治疗功效。同样，两个物种之间发现的显着相似性的功能意义在未来的研究中可能非常重要，涉及外源性 IL-1Ra 的使用。LYS290 和 ASP259 在两种配体的对接中很常见。这说明两种配体的结合位点明显相似，表明两种配体可能具有相同的治疗功效。同样，两个物种之间发现的显着相似性的功能意义在未来的研究中可能非常重要，涉及外源性 IL-1Ra 的使用。