植物生物化学与生理学杂志
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抽象的

苜蓿 L. β-淀粉酶核心启动子与拟南芥关键淀粉降解基因具有共同基序

Brett Fugate、Denise Medrano、Joyce Ache Gana、Aida Abraha 和 Suzanne M Cunningham

β-淀粉酶是参与植物光合组织中瞬时淀粉降解
的酶，在苜蓿根部高水平表达。β-淀粉酶基因MsBAM1在
根部的调控机制尚不清楚。本研究的目的是：分离 MsBAM1 的核心启动子，在计算机中破译
与根特异性反应升高相关的基序，并找到
苜蓿 MsBAM1 和拟南芥 (AtGWD) 中重要淀粉降解基因的核心启动子之间的共同基序。 、AtPWD、AtMEX1、
AtBAM 1 和 3 以及 AtISA3）。引物由同源 β-淀粉酶基因设计并用于 PCR
苜蓿 gDNA。对凝胶纯化的 PCR 条带进行测序、验证和注释。通过转录因子结合位点数据库（PLACE）分析淀粉基因和同等
数量的拟南芥
非淀粉基因启动子。对淀粉和非淀粉基因之间的基序频率进行统计分析。
在 MsBAM1 核心启动子中鉴定出TATA-box 基序。卡方和 Fisher 精确检验分析揭示了
淀粉和非淀粉
基因之间基序 ROOTMOTIFTAPOX1 (RMP1) 和 GATABOX (GATA) 的频率显着性，但 DOF 基序没有显着性。在 MsBAM1 和所有拟南芥中检测到 RMP1 和 GATA 基序
淀粉降解基因但仅存在于少数非淀粉基因中。
然而，在所有淀粉和非淀粉降解基因中都发现 DOF 基序的频率相似。
这些基序可能与其他已知的顺式调节元件结合使用，以赋予苜蓿根部增强的表达和
淀粉降解途径中的共转录调节