蛋白质组学与生物信息学杂志
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雉鸡和鹌鹑禽类 β-防御素 2 肽的鉴定和结构表征

L Kannan、R Liyanage、JO Lay Jr.、B Packialakshmi、NB Anthony 和 NC Rath

通过使用基质辅助激光解吸电离飞行时间 ( MALDI-TOF ) 质谱 (MS) 筛选异嗜提取物、比较分析、化学和生物信息学表征，鉴定了禽类 β-防御素 2 (AvBD2) 的雉鸡和鹌鹑直系同源物。在每只雉鸡和鹌鹑的异嗜提取物中，我们观察到单个高强度质量峰，分别对应于 m/z 4114.8 和 4163.8，在还原和烷基化时，质量差移动了 348 Da，表明 3 个内部二硫键发生了修饰这些肽中存在的键。未修饰的肽，m/z 4114 和 4163，及其脲甲基化 ( CAM)衍生物通过反相HPLC纯化。使用纯化的肽，我们通过胰蛋白酶消化，然后进行 MALDI-TOF-MS、MALDI LIFT-TOF/TOF 和 Edman 降解来确定其部分序列，这表明它们与其他 AvBD2 具有明确的同源性。结合所有结果并将序列延伸与来自其他鸟类物种的成熟AvBD2进行比对，我们推导出雉鸡和鹌鹑直系同源物的氨基酸序列分别为LFCKRGSCHFGRCPSHLIKVGSCFGFRSCCKWPWNA和LFCRRGTCHFGNCPSDQIKVGNCFGFRSCCRWPWDA。这些序列信息通过 MALDI 源内衰变 (ISD) 分析得到进一步证实。雉鸡和鹌鹑 AvBD2 肽均与其他已知的 AvBD2 序列显示出显着的同一性 (>80%)。