转录组学：开放获取
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抽象的

甜菊中新型 MicroRNA 的鉴定及其靶点预测

维巴·曼丹和克什米尔·辛格

甜叶菊因其营养重要性及其作为天然甜味剂的新兴用途而受到全世界的关注。为了更好地了解这种植物的基因调控网络，我们启动了高通量小RNA测序，以发现新的microRNA (miRNA)。miRNA是一类长度约为18-22个核苷酸的短内源性非编码小RNA分子，其主要功能是通过翻译抑制、mRNA切割和表观遗传修饰等不同方式下调基因表达。我们构建了S. rebaudiana sRNA文库，并使用Illumina基因组分析仪II对其进行测序后，总共获得了代表2,509,190个不同序列的30,472,534个读数。从这些读物中，预测了 12 12 个新的 miRNA，其前体可能是从甜菊 EST 和核苷酸序列生成的。之前尚未在甜叶菊或其他植物物种中描述过所有新序列。大多数新型 miRNA 的推定靶基因均被预测，其中主要包括编码调节重要植物代谢和信号通路的酶的 mRNA。我们的结果增加了甜菊中 miRNA 的数量，这对于进一步研究甜菊和其他植物物种中 miRNA 的生物学功能和进化应该是有用的。