蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

用于测量整体 DNA 甲基化和羟甲基化的液相色谱串联质谱法

刘佳、卢克·B·赫森和罗宾·L·沃德

DNA甲基化是一种重要的表观遗传现象。基因组中的整体 DNA 甲基化水平具有组织特异性，并且在特定的发育和病理状态下会降低。因此需要准确的测定来量化整体 DNA 甲基化。在这篇综述中，我们描述了全球 DNA 甲基化测量的不同方法，并解释了用于 5-甲基胞嘧啶和 5-羟甲基胞嘧啶定量的金标准测定液相色谱串联质谱 (LC-MS/MS) 的方法、优点和局限性。使用 LC-MS/MS 测量整体 DNA 甲基化有助于阐明环境暴露和可改变 DNA 甲基化水平的去甲基化药物的影响，使用该技术的进一步研究可能会为预防和/或逆转 DNA 低甲基化提供见解。