真菌基因组学与生物学

真菌基因组学与生物学
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国际标准期刊号: 2165-8056

抽象的

花生黑穗病病原黑穗菌的线粒体基因组和核编码杀菌剂靶基因

Renee S. Arias、Luis I. Cazon、Alicia N. Massa、Brian E. Scheffler、Victor S. Sobolev、Marshall C. Lamb、Mary V. Duke、Sheron A. Simpson、Cinthia Conforto、Juan A. Paredes、Juan H . 索阿韦、马里奥·布特勒和亚历杭德罗·M·拉戈

背景:Thecaphora frezii Carranza 和 Lindquist 会引起花生 ( Arachishypogaea L. )黑穗病,导致高达 35% 的产量损失。杀菌剂已证明无法有效控制该病害;然而,由于缺乏有关T. frezii的遗传信息,对该杀菌剂抗性的分子基础的研究受到了阻碍。这项工作的目标是提供有关T. frezii 中杀菌剂目标位点的分子信息,包括其线粒体基因组(丝裂基因组)和关键的核编码基因。

结果:在这里,我们报告了T. frezii的完整注释线粒体基因组,这是一种 123,773 bp 的分子,包含构成线粒体复合物 I、III、IV 和 V 一部分的标准 14 个基因、22 个转移 RNA、核糖体 RNA 的小和大亚基、DNA聚合酶、核糖核酸酶 P、GII-逆转录酶/成熟酶、九种假设的开放阅读框和归巢核酸内切酶(LAGLIDADG、GIY-YIG、HEG)。此外,我们还报告了T. frezii 细胞色素 b (cob) 和细胞色素氧化酶 1 (cox1) 基因的全长 cDNA 序列;以及T. frezii 琥珀酸脱氢酶 (sdhb)、麦角甾醇生物合成 (Erg4)、细胞色素 P450 (cyp51) 和 β 微管蛋白 (β-微管蛋白) 基因的部分序列,它们分别是花生作物中常用的嗜球果伞素类、醌类氧化抑制剂、三唑类和β-微管蛋白抑制剂类杀菌剂的靶标。这种特殊的T. frezii分离物中cob 和sdhb基因的翻译表明对甲氧基丙烯酸酯和甲酰胺类杀菌剂具有潜在的抗性。

结论:这里提出的有丝分裂基因组和核编码基因序列为研究弗氏毛霉杀菌剂靶位点提供了分子工具。

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