蛋白质组学与生物信息学杂志
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谷物和小米钙调蛋白基因的分子克隆和比较计算机分析，以了解差异钙积累的机制

马诺吉·纳斯 (Manoj Nath)、安希塔·戈尔 (Anshita Goel)、戈哈尔·泰吉 (Gohar Taj) 和阿尼尔·库马尔 (Anil Kumar)

钙调蛋白基因（CaM）——通过聚合酶链式反应技术克隆的钙传感器(PCR) 使用从 dbEST 数据库中提供的牛筋草 EST 设计的单组引物对谷物和小米进行 PCR。除狗尾草外，在所有谷物和小米中均观察到 613bp 的 PCR 扩增子。来自这些谷物的扩增子被进一步凝胶洗脱、克隆、测序并进行同源性搜索、多序列比对、系统发育树构建和基序分析。同源性搜索证实了它们与除普通小麦之外的 CaM 基因的同一性。翻译的 CaM 氨基酸序列的多重序列比对证实了 110 个氨基酸的保守共有序列的存在，这在除高粱之外的不同谷物和小米中均观察到。基于克隆的 CaM 基因的蛋白质序列构建的系统发育树揭示了与其他也具有较高浓度的谷类和小米相比，三个牛筋草品种（PRM-1、PRM-701 和 PRM-801）与大麦之间的密切进化关系。种子中的钙。由此表明CaM的结构变异在钙的差异积累中具有一定作用。与 CaM 基因相关的 3 只 EF 手始终存在，但双色高粱只有 2 只 EF 手。克隆序列的计算机 3D 结构分析显示出相似的模式，并揭示了 CaM 在结构和与钙离子相互作用方面的高度保守性，从而反映了进一步研究 CaM 的作用 PRM-701 和 PRM-801) 和大麦与其他谷物和小米相比，种子中的钙浓度也更高。由此表明CaM的结构变异在钙的差异积累中具有一定作用。与 CaM 基因相关的 3 只 EF 手始终存在，但双色高粱只有 2 只 EF 手。克隆序列的计算机 3D 结构分析显示出相似的模式，并揭示了 CaM 在结构和与钙离子相互作用方面的高度保守性，从而反映了进一步研究 CaM 的作用 PRM-701 和 PRM-801) 和大麦与其他谷物和小米相比，种子中的钙浓度也更高。由此表明CaM的结构变异在钙的差异积累中具有一定作用。与 CaM 基因相关的 3 只 EF 手始终存在，但双色高粱只有 2 只 EF 手。克隆序列的计算机 3D 结构分析显示出相似的模式，并揭示了 CaM 在结构和与钙离子相互作用方面的高度保守性，从而反映了进一步研究 CaM 的作用 与 CaM 基因相关的 3 只 EF 手始终存在，但双色高粱只有 2 只 EF 手。克隆序列的计算机 3D 结构分析显示出相似的模式，并揭示了 CaM 在结构和与钙离子相互作用方面的高度保守性，从而反映了进一步研究 CaM 的作用 与 CaM 基因相关的 3 只 EF 手始终存在，但双色高粱只有 2 只 EF 手。克隆序列的计算机 3D 结构分析显示出相似的模式，并揭示了 CaM 在结构和与钙离子相互作用方面的高度保守性，从而反映了进一步研究 CaM 的作用同种型，它们的表达模式以及与参与钙积累的运输机制的下游相互作用。