分枝杆菌病
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苏丹喀土穆州分离的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子流行病学

哈娜·埃尔巴达维

鲍曼不动杆菌已成为一种重要的多重耐药微生物，与全世界的医院感染有关。本研究旨在利用从苏丹喀土穆州患者分离的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌（CRAb）的全基因组测序（WGS）来探讨分子流行病学和抗菌药物耐药机制。2016 年 10 月至 2017 年 2 月期间，从喀土穆州两家医院患者的各种临床标本中收集了 22 个非重复 CRAb。最初使用表型和 PCR 检测方法对 gyrB、OXA 组（OXA-23、-40、-51、-58、-143 和 -235）和内部多重 PCR 进行物种鉴定和碳青霉烯类耐药机制研究PCR 检测编码 NDM、IMP、VIM、GIM、KPC 和 GES 的基因。通过WGS（Illumina MiSeq）对分离株进行了进一步表征，并鉴定了分子流行病学特征和耐药机制。所有分离株均具有碳青霉烯类表型耐药性，并含有多个 β-内酰胺酶基因。在 21/22 (95%) 的分离株中检测到编码获得性 OXA-23 的基因，其中 3 个分离株同时携带 OXA-58。检测到的其他碳青霉烯酶为：NDM-1 4/22 (18%) 和 GES-11 2/22 (9%)。在 20/22 (90%) 的分离株中检测到 TEM-1D。一种分离株具有 blaOXA-51 上游的 ISAba1，以及编码 OXA-1 和 CTX-M-15 的基因。此外，还检测到许多其他获得性抗性基因，这些基因赋予对氨基糖苷类、大环内酯类、氟喹诺酮类、苯酚类、四环素类、磺胺类和甲氧苄啶的抗性。19/22 (86%) 的分离株与 IC2 聚集并具有内在的 blaOXA-66。具有不同 IC 的两个分离株均具有内在 OXA 基因：IC1 带有 blaOXA-69，IC5 带有 blaOXA-91。散发的分离株含有 blaOXA-51。基于 cgMLST 的分子分型揭示了两个传播群，其中包含来自两家医院的分离株，分别为 12 个和 3 个分离株。总之，我们的 CRAb 分离株主要属于 IC2，是我们当地环境中的一个突出问题。产生 OXA-23 的分离株通常具有编码 NDM-1、GES-11 和 OXA-58 的其他抗性基因。为了预防，必须加强筛查、监测和感染控制。和3个分离株。总之，我们的 CRAb 分离株主要属于 IC2，是我们当地环境中的一个突出问题。产生 OXA-23 的分离株通常具有编码 NDM-1、GES-11 和 OXA-58 的其他抗性基因。为了预防，必须加强筛查、监测和感染控制。和3个分离株。总之，我们的 CRAb 分离株主要属于 IC2，是我们当地环境中的一个突出问题。产生 OXA-23 的分离株通常具有编码 NDM-1、GES-11 和 OXA-58 的其他抗性基因。为了预防，必须加强筛查、监测和感染控制。