蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

与结直肠癌中 ALDH 亚群相关的蛋白质标记物

Rui Yang、刘新华、Smathorn Thakolwiboon、Jianhui Zhu、Xiucong Pei、Mingrui An、Zhijing Tan 和 David M Lubman

ALDH 已被证明是一种标记物，表示结直肠癌和其他癌症中的癌症干细胞亚群。该细胞亚群显示出肿瘤发生、转移以及对化疗和放疗产生耐药性从而导致复发和死亡的风险增加。因此，确定结肠癌中与 ALDH1+ CSC 相关的重要信号通路至关重要。基本问题是从异质组织中分离出纯细胞亚群以进行进一步分析。为了实现这一目标，结直肠癌组织III 期患者用 ALDH1 抗体进行免疫染色。使用激光捕获显微切割 (LCM) 对来自同一组织的目标 ALDH1+ 和 ALDH1- 细胞进行显微切割。使用 LC-MS/MS 裂解捕获的细胞并进行分析，其中大约 20,000 个细胞可供分析。该分析产生了 134 种蛋白质在三个患者样本对中，ALDH1+ 和 ALDH1- 细胞之间存在差异表达。基于这些差异表达的蛋白质，进行了 IPA 通路分析，显示了细胞间信号传导以及有机体损伤和异常中的两条关键通路。IPA 分析显示 β-连环蛋白、NFκB (p65) 和 TGFβ1 是这些通路中重要的癌症相关蛋白。使用包括 170 个病例的组织微阵列进行免疫荧光染色的 TMA 验证，验证了与 ALDH1- 细胞相比，这些关键蛋白在结肠癌组织中的 ALDH1+ 细胞中高度过表达。