蛋白质组学与生物信息学杂志
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尤文肉瘤的蛋白质组分析揭示了 TRAF6 在增殖和核糖核蛋白/RNA 加工中的作用

胡安·马多斯-古尔皮德、大卫·埃雷罗-马丁、贡萨洛·戈麦斯-洛佩斯、卢尔德·洪泰西利亚斯-普列托、米歇尔·比斯库拉、克里斯蒂娜·查米索、丹尼尔·加西亚-多明格斯、大卫·马西拉、安娜·特雷莎·阿马拉尔、何塞·路易斯·奥多内斯和恩里克·德阿拉瓦

尽管过去十年对尤文肉瘤 (ES) 分子生物学的理解取得了进展，但我们仍然缺乏对关键问题的理解，尤其是有关其起源的问题。特别是，很少有人致力于表征由染色体易位引起的融合蛋白的激活所部署的机制和途径的蛋白质成分。我们决定研究具有代表性融合蛋白的 ES 细胞系的蛋白质变化。ES 细胞系 TC-71 中 EWSFLI1 的 RNA 干扰、通过二维电泳进行的蛋白质组分析和随后的质谱鉴定以及全局过度代表性研究相结合，检测到了 500 多个点的变化。四十三种蛋白质被鉴定为丰度显着差异。正如预期的那样，我们发现并验证了与核苷酸加工、转录调控、核糖核蛋白、解旋酶、细胞周期控制和增殖以及代谢过程相关的蛋白质的变化。此外，TNF 受体相关因子 6 被揭示为中枢节点。我们的策略显示了揭示与融合蛋白已知功能相关的蛋白质相互作用的潜力：与DNA和RNA结合以充当异常转录因子或有效的阻遏物，或者通过改变RNA加工。