蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

与癌发生和转移相对应的胰腺癌细胞系的蛋白质组学特征

山田正代、藤井清永、小山浩二、广桥节男、近藤正

研究致癌作用的蛋白质组背景为了研究胰腺癌的进展和进展，研究人员检查了九种特征明确的胰腺腺癌细胞系（其转移潜力之前已在小鼠异种移植模型中进行过检查）和两种永生化胰管细胞系的蛋白质表达谱。二维差异凝胶电泳（2D-DIGE）鉴定出126个蛋白点，其强度在正常胰管细胞系和具有不同转移潜能的胰腺癌细胞系之间存在显着差异。质谱蛋白质鉴定表明，这些蛋白质点对应于 95 个独特基因，其中包括以前未显示出在胰腺癌中异常的蛋白质。为了表征观察到的蛋白质组，LC-MS/MS 鉴定了与 2D-DIGE 检测到的 1101 个蛋白质点相对应的蛋白质。所有 1101 个蛋白质点的得分最高的蛋白质对应于 459 个独特的蛋白质。561 个单一蛋白质点包含多种蛋白质，213 个独特蛋白质被重复检测为多个蛋白质点中得分最高的蛋白质。这些结果表明 2D-DIGE 捕获了广泛的蛋白质组，并具有检测与胰腺癌发生和进展相关的蛋白质的潜力。获得的蛋白质表达和鉴定数据已纳入我们的公共数据库——日本蛋白质组学基因组医学数据库。213 个独特的蛋白质在多个蛋白质点中被重复检测为得分最高的蛋白质。这些结果表明 2D-DIGE 捕获了广泛的蛋白质组，并具有检测与胰腺癌发生和进展相关的蛋白质的潜力。获得的蛋白质表达和鉴定数据已纳入我们的公共数据库——日本蛋白质组学基因组医学数据库。213 个独特的蛋白质在多个蛋白质点中被重复检测为得分最高的蛋白质。这些结果表明 2D-DIGE 捕获了广泛的蛋白质组，并具有检测与胰腺癌发生和进展相关的蛋白质的潜力。获得的蛋白质表达和鉴定数据已纳入我们的公共数据库——日本蛋白质组学基因组医学数据库。