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妊娠晚期和哺乳高峰期 Mac-T 细胞与乳腺组织的转录组学比较

阿夫辛·侯赛尼、雷卡·夏尔马、马西莫·比奥纳兹和胡安·J·洛尔

上皮细胞培养物，包括永生化细胞，已被广泛用于帮助回答正常或患病条件下乳腺生理学的基本问题。使用细胞培养物的有用性取决于与体内乳腺上皮相比的识别程度。我们的目的是通过微阵列和 qPCR 比较在塑料（即二维系统）中培养的永生化牛乳腺上皮细胞 (Mac-T) 与妊娠晚期 (-30 DIM) 和峰值期间获得的乳腺组织的转录组。哺乳期（+60 DIM）。使用富集分析工具和动态影响方法（DIA）对微阵列数据进行功能分析。总体而言，介于 37%（对比 +60 DIM）和 44%（对比 +60 DIM）之间。-30 DIM) 测量的注释基因被认为是 Mac-T 细胞和乳腺组织之间的差异表达 (DEG)。这些数据与非差异表达基因的生物信息学结果一起表明，Mac-T 细胞与哺乳期乳腺组织之间的总体相似性高于非哺乳期乳腺组织。然而，通过 qPCR 测量，与乳腺组织相比，Mac-T 细胞的乳汁合成相关基因的表达较低。DEG 的功能分析进一步支持 Mac-T 细胞与乳腺组织相比较差的泌乳表型。DEG 的生物信息学分析表明，在塑料上培养的 Mac-T 细胞更依赖葡萄糖、氨基酸和脂肪酸来产生能量，细胞间相互作用更强，相对于乳腺组织，更容易对炎症介质产生反应。尽管存在这些差异，但数据表明 Mac-T 细胞可能足以研究乳蛋白调节。对于乳脂调节研究，Mac-T 细胞可能不如乳腺组织敏感，特别是其 PPARG 表达较低以及 PPARγ 和 LXR 相关途径诱导较低。总体而言，这项研究揭示了乳腺组织和在塑料上培养的 Mac-T 细胞之间的转录组特征存在显着差异。