真菌基因组学与生物学
开放获取

抽象的

我们什么时候将基因上不同的菌株称为不同的物种？- 炭疽菌 (Colletotrichum gloesporioides) 物种复合体的警示性案例研究

徐建平、李何、周国英、刘俊昂

不同的标准被用来定义真菌物种。由于 DNA 序列信息的可用性不断增加，系统发育物种概念 (PSC) 已在真菌分类学家中流行起来。然而，关于用于定义密切相关的类群之间“系统发育独特性”的标准以及需要哪些其他标准才能衍生出更强大的物种仍存在争议。在最近的一项研究中，我们报告了导致中国南方油茶树叶片炭疽病的 199 种真菌病原体炭疽菌复合体 (CGSC) 菌株的四个基因位点的 DNA 序列。我们的组合序列分析将 199 个分离株中的 194 个聚类为 CGSC 内先前描述的 22 个物种中的 4 个：Colletotrichum fructicola（167 个分离株）、暹罗炭疽菌（19 个分离株）、胶孢炭疽菌（6 个分离株）和山茶炭疽菌（2 个分离株）。其余 5 个分离株与所有 22 个已知物种明显不同。利用这些数据，我们进一步调查了样本中这些物种的生殖隔离程度。我们的分析揭示了三个“系统发育物种”之间以及它们与五个未分配的分离株之间广泛的等位基因共享。此外，有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）（6 个分离株）和山茶炭疽菌（Colletotrichum Camelliae）（2 个分离株）。其余 5 个分离株与所有 22 个已知物种明显不同。利用这些数据，我们进一步调查了样本中这些物种的生殖隔离程度。我们的分析揭示了三个“系统发育物种”之间以及它们与五个未分配的分离株之间广泛的等位基因共享。此外，有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）（6 个分离株）和山茶炭疽菌（Colletotrichum Camelliae）（2 个分离株）。其余 5 个分离株与所有 22 个已知物种明显不同。利用这些数据，我们进一步调查了样本中这些物种的生殖隔离程度。我们的分析揭示了三个“系统发育物种”之间以及它们与五个未分配的分离株之间存在广泛的等位基因共享。此外，有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。在这里，我们进一步研究了样本中这些物种之间的生殖隔离程度。我们的分析揭示了三个“系统发育物种”之间以及它们与五个未分配的分离株之间广泛的等位基因共享。此外，有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。在这里，我们进一步研究了样本中这些物种之间的生殖隔离程度。我们的分析揭示了三个“系统发育物种”之间以及它们与五个未分配的分离株之间存在广泛的等位基因共享。此外，有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。有大量证据表明这四个物种中的三个物种之间普遍存在重组。我们的结果表明，在命名新物种时应谨慎，并强调大规模群体遗传学研究在帮助确定生殖隔离和物种边界方面的重要性。