蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

牛、绵羊和山羊生长停滞和 DNA 损伤诱导蛋白 45 Alpha 基因的生物计算分析

Ayuba Dauda*、Okon B、伊博姆 LA

GenBank 数据库总共产生了来自山羊 (5)、绵羊 (5) 和牛 (5) 的十五 (15) 个生长停滞和 DNA 损伤诱导蛋白 45 Alpha ( GADD45A ) 基因核苷酸序列。GADD45A的非同义单核苷酸多态性使用PROVEAN工具检查牛、山羊和绵羊的氨基酸取代基因。特定的氨基酸替代被发现是中性/有益的,而其他氨基酸替代则被证明是有害/有害的。Tajima 使用分子进化遗传学分析 (MEGA) 5.0 对牛、山羊和绵羊进行了测试和系统发育关联。Tajima 的测试(D)对所有物种都产生了良好的结果,表明纯化选择。由于牲畜的改良取决于基因型和表型相互作用的知识,系统发育联系揭示了物种间和物种内的高水平混合,因此选择该基因对于建立牲畜发展的育种计划可能很有价值。

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