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冷处理早熟禾（Poa pratensis）的从头转录组测序及耐冷相关基因分析

张L，任J，李T，王A，谭D

早熟禾（Poa pratensis））对冷应激有很强的抵抗力。尽管植物响应冷胁迫的分子机制已在模型植物中得到广泛记录，但人们对早熟禾在基因组水平上的耐冷性知之甚少。在这里，我们通过 RNA 测序和从头组装比较了冷处理（-5°C）和对照处理（20°C）下肯塔基早熟禾的转录组。总共生成了75,934个unigene，其中53,762个在公共数据库中成功注释。通过比较对照植物和冷处理植物的转录组，发现 3,896 个 unigene 存在差异表达。在这些基因中，在冷处理的植物中，2,410 个基因下调，1,486 个基因上调。鉴定了一些先前报道的冷诱导蛋白、抗氧化酶和渗透调节蛋白，并估计了它们的表达水平。此外，选取10个差异表达基因进行qRT-PCR验证。它们的表达模式与RNA-seq的结果一致。另外，转录因子家族，即乙烯反应因子、热应激转录因子、NAC蛋白、含有WRKY结构域的蛋白和生长素反应因子，被鉴定为差异表达基因。这些相关基因的鉴定将有助于植物耐冷转录调控的研究。热应激转录因子、NAC蛋白、WRKY结构域蛋白和生长素反应因子被鉴定为差异表达基因。这些相关基因的鉴定将有助于植物耐冷转录调控的研究。热应激转录因子、NAC蛋白、WRKY结构域蛋白和生长素反应因子被鉴定为差异表达基因。这些相关基因的鉴定将有助于植物耐冷转录调控的研究。