蛋白质组学与生物信息学杂志
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肝细胞癌中差异表达尿蛋白的鸟枪法蛋白质组学分析

郭超仁、王申念、梁世信、池淑文、宗敬宇、许嘉华、李敬德、邱史宏

文献中普遍报道了基于血清中乙型肝炎病毒表面抗原（HbsAg）浓度和尿液中黄曲霉毒素代谢物的肝细胞癌（HCC）诊断以及早期检测的大量研究。迄今为止，这些生物标志物尽管特异性和准确，但并不能普遍用于检测所有致病因素引起的 HCC。此外，与存在丰富的动态范围宽的干扰蛋白相比，潜在的生物标志物可能以低浓度存在。本研究的目的是建立一个有效、非侵入性诊断工具的操作分析平台，具有高灵敏度，通过使用纳米液相色谱-串联质谱（nanoLC-MS/MS）和稳定同位素二甲基，通过鸟枪蛋白质组学探索蛋白质表达谱标签。通过蛋白酶消化产生的肽片段的质谱模式来鉴定和比较差异表达的尿蛋白。在我们的结果中，对尿液中差异表达蛋白质的定量蛋白质组学分析鉴定出至少 21 个具有高置信度的候选蛋白质生物标志物。我们进一步鉴定了 14 种蛋白上调（稳定同位素 D/H 比值≥ 1.5）和 7 种蛋白下调（D/H 比值≤ 0.6）。这些已鉴定的标记蛋白的系统性减少或增加可能反映了 HCC 进展过程中肝脏的形态畸变和患病阶段。这些结果将为未来将一些已识别的生物标志物验证和临床转化为各类 HCC 的靶向诊断和治疗奠定坚实的基础。