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膀胱癌肿瘤微环境中与免疫细胞浸润相关的MMP9预后标志物

林汉生、刘万万、冯能卓、钟双泽、陈尚进、何静伟*、梁健*

背景：膀胱癌（BLCA）是最常见的人类癌症之一，其发病率呈上升趋势，尤其是在女性中。肿瘤微环境（TME）在肿瘤的发生和进展中发挥着重要作用。我们调查了癌症基因组图谱计划数据库中 BLCA 的表达谱，并研究了可能影响肿瘤微环境 (TME) 组成的基因。然后我们分析了基因与肿瘤预后之间的关系，寻找可能为 BLCA 诊断和治疗带来新风格的免疫预后标志物。

方法：从癌症基因组图谱（TCGA）中获取BLCA的RNA-seq数据；利用恶性组织表达中基质和免疫细胞的估计（ESTIMATE）数据算法来计算免疫和基质评分。对差异表达基因进行COX回归分析，并用于构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。

结果：交叉分析表明基质金属蛋白酶9 ( MMP9 ) 是唯一的交叉基因。我们通过估计 RNA 转录子相对子集进行细胞类型识别 (CIBERSORT) 算法计算了 BLCA 中肿瘤浸润免疫细胞 (TIC) 的百分比。建立了 TIC 中MMP9高表达组和低表达组的差异。然后将每种 TIC 中MMP9的表达水平进行相关。通过生存、临床和富集分析，发现MMP9是 BLCA 的免疫预后因素，并在肿瘤微环境中发挥重要作用。最终， MMP9之间的相关性分析免疫检查点基因表明MMP9可以预测BLCA免疫治疗的效果。

结论： MMP9是一种免疫预后标记基因。MMP9通过多种途径参与调节BLCA的免疫过程，并与PD-1和CTLA4免疫靶点密切相关。MMP9的表达可能影响BLCA的预后，提示其可能是BLCA的预后相关标志物。